33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0844 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 421 aa  859    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  42.04 
 
 		 433 aa  302  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  38.16 
 
 		 446 aa  299  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1727  hypothetical protein  29.85 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  26.5 
 
 		 380 aa  93.2  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  26.03 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 374 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.92 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  26.03 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  24.89 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 360 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 362 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  23.56 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  24.03 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  24.04 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  22.3 
 
 		 321 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 367 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.81 
 
 		 365 aa  43.5  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  25.29 
 
 		 343 aa  43.5  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>