41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1803 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  100 
 
 		 321 aa  661    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  54.31 
 
 		 314 aa  335  9e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  52.98 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  54.37 
 
 		 323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  45.03 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  43.16 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  44.82 
 
 		 331 aa  223  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  40.12 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  38.46 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  41.28 
 
 		 322 aa  208  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  36.31 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  32.05 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  30.71 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  22.27 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.22 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  23.66 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  25.81 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.4 
 
 		 365 aa  52.8  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  25.52 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 421 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  26.43 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  26.43 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  25.71 
 
 		 405 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>