64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_13141 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  67.31 
 
 
362 aa  537  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  68.72 
 
 
365 aa  527  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  54.47 
 
 
356 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  52.51 
 
 
367 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  54.34 
 
 
356 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  52.22 
 
 
359 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  53.07 
 
 
367 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  52.94 
 
 
360 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  53.37 
 
 
360 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  51.96 
 
 
367 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  50.28 
 
 
371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  52.21 
 
 
362 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  55.84 
 
 
323 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  55.15 
 
 
370 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  48.17 
 
 
379 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 
374 aa  293  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 
337 aa  275  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  42.33 
 
 
351 aa  265  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 
356 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 
405 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 
266 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  23.72 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  26.11 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  23.64 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  23.27 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  24 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  23.76 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 
314 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  21.55 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  21.85 
 
 
330 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  21.88 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  22.57 
 
 
327 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  25 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  24.32 
 
 
321 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 
421 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  23.51 
 
 
446 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  22.38 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  21.74 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 
351 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6000  radical SAM domain-containing protein  21.69 
 
 
380 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  20.71 
 
 
383 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 
368 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  23.2 
 
 
354 aa  46.2  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  24.55 
 
 
351 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  26.7 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  26.7 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  22.08 
 
 
355 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 
419 aa  43.5  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 
290 aa  43.5  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 
308 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  21 
 
 
433 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1727  hypothetical protein  22.07 
 
 
421 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  26.55 
 
 
302 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>