25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6000 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_6000  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  782    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  55.03 
 
 		 375 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  23.4 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.38 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.01 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  24.45 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  20.44 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  23.18 
 
 		 360 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  25.2 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  23.34 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  20.59 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  21.56 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  23.9 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  23 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  24.9 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  20.63 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>