37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0196 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  94.01 
 
 		 401 aa  802    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  88.25 
 
 		 405 aa  759    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  841    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 367 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  26.27 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.78 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  27.34 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.34 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  22.18 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  23.39 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  24.15 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 331 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  23.76 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  28.71 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1727  hypothetical protein  23.65 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  22.39 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  21.86 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  26.43 
 
 		 321 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>