134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0596 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  661    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  60.7 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  52.98 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  55.28 
 
 		 323 aa  341  8e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  44.86 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  43.69 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  44.31 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  43.21 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  43.17 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  42.46 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  40.06 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  24.3 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.1 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  24.21 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  34.66 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.58 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  23.9 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  34.66 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  23.08 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  23.11 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  27.75 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0381  lipoyl synthase  28.48 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.224918  hitchhiker  0.0000000000185759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  31.64 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  23.01 
 
 		 295 aa  53.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0470  lipoyl synthase  24.43 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  22.69 
 
 		 374 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  24.86 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  22.52 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1072  hypothetical protein  29.51 
 
 		 414 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  27.12 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  27.12 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 375 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  27.12 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  25.42 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  24.52 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  23.86 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  24.43 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  24.16 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  23.86 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  23.86 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  25.42 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  24.52 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  24.52 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  24.52 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  24.52 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1427  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  21.91 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0581575  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  24 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  23.86 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  25 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  26.55 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  25.24 
 
 		 446 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  26.74 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  24.04 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  22.73 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  24.72 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0856  hypothetical protein  29.23 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  25.41 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  21.8 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  23.56 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  25.42 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  27.23 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1336  hypothetical protein  27.27 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00270043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  26.17 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1961  lipoyl synthase  24.73 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  23.56 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  23.56 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  23.56 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  23.56 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  23.56 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  25.42 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>