39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0963 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  781    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  22.48 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 421 aa  93.2  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  27.21 
 
 		 323 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  24.19 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  22.32 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  25.39 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.17 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  23.4 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  22.44 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  20.45 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.19 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  21.48 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6000  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  24.15 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  24.15 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  24.15 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1727  hypothetical protein  20.37 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  23.48 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  21.21 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  28.57 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  32.98 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  22.31 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>