73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2714 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  87.57 
 
 		 360 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  97.75 
 
 		 356 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 356 aa  724    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  80.45 
 
 		 359 aa  608  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  82.3 
 
 		 360 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  77.37 
 
 		 362 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  70.79 
 
 		 367 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  71.35 
 
 		 367 aa  531  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  71.07 
 
 		 367 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  66.76 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  67.7 
 
 		 370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  67.92 
 
 		 323 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  58.66 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  57.46 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  54.34 
 
 		 362 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  53.09 
 
 		 379 aa  359  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  45.35 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  47.66 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  45.99 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  30.94 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  26.27 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  27.35 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  22.18 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  26.07 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  26.46 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  28.4 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  23.32 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14130  radical SAM enzyme, Cfr family  29.37 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  22.38 
 
 		 375 aa  53.1  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  29.55 
 
 		 367 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  25.16 
 
 		 321 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  28.35 
 
 		 354 aa  49.7  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  23.36 
 
 		 446 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  25.6 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 371 aa  46.6  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6000  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  28.83 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.67 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  27.91 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  27.13 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  24.6 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  28.12 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  25.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  29.01 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  25.74 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  25.4 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  20.62 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.5 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1727  hypothetical protein  21.03 
 
 		 421 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  24.22 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5825  hypothetical protein  27.07 
 
 		 433 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>