41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2140 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 323 aa  655    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  57.64 
 
 		 314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  55.28 
 
 		 322 aa  344  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  54.37 
 
 		 321 aa  333  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  43.83 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  43.38 
 
 		 331 aa  255  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  43.65 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  43.83 
 
 		 331 aa  248  8e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  45.57 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  40.74 
 
 		 330 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  40.87 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.56 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  27.11 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  29.95 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  27.81 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  26.04 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.26 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 266 aa  49.7  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  24.21 
 
 		 446 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>