50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0681 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  585  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  92.23 
 
 		 283 aa  545  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  49.29 
 
 		 296 aa  258  9e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  45.3 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 		 290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  39.26 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 355 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  29.75 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 371 aa  105  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 378 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 378 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  24.01 
 
 		 383 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 390 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  26.87 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0251  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.996674  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  24.15 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  23.83 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 370 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 346 aa  45.8  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  21.72 
 
 		 345 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  24.62 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  26.23 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  22.68 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3729  radical SAM domain-containing protein  20.34 
 
 		 393 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1031  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.84 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50634  predicted protein  22.39 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.612985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1798  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 		 377 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0702083  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.08 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  23.86 
 
 		 364 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  26.92 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  23.03 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.78 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  25.96 
 
 		 356 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.22 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4146  radical SAM domain-containing protein  22.59 
 
 		 403 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.78 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1309  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 423 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  20 
 
 		 344 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  20.56 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.491091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>