108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1798 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1798  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 377 aa  768    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0702083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0306  hypothetical protein  43.11 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825598  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2639  hypothetical protein  43.31 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1926  Radical SAM domain protein  43.13 
 
 		 415 aa  301  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000517647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0407  radical SAM family protein  43.64 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162852  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0393  Radical SAM domain protein  43.84 
 
 		 397 aa  298  8e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00226682  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1575  hypothetical protein  42.67 
 
 		 420 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00249963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4389  radical SAM domain-containing protein  40.97 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1309  radical SAM domain-containing protein  41.99 
 
 		 423 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2338  Radical SAM domain protein  41.99 
 
 		 402 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278935  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0246  hypothetical protein  42.71 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4146  radical SAM domain-containing protein  41.03 
 
 		 403 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3729  radical SAM domain-containing protein  41.51 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2852  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2123  radical SAM domain-containing protein  41.47 
 
 		 406 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0767294  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1192  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.63 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.052698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1467  radical SAM domain-containing protein  42.37 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0281391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0320  hypothetical protein  40.47 
 
 		 419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2365  radical SAM family protein  41.1 
 
 		 406 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229751  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2166  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 386 aa  281  9e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.978798  hitchhiker  0.00000549931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2924  radical SAM domain protein  40.68 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2768  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.723195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2003  Radical SAM domain protein  40.82 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1724  Radical SAM domain protein  42.45 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.408853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1759  radical SAM family protein  39.85 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1900  radical SAM family protein  39.03 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.308107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1282  radical SAM domain-containing protein  40.2 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05010  Radical SAM domain protein  41.73 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0228  hypothetical protein  41.22 
 
 		 417 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2984  hypothetical protein  39.53 
 
 		 412 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0923725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0194  Radical SAM domain protein  41.53 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0347  hypothetical protein  41.36 
 
 		 420 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2714  Radical SAM domain protein  41.6 
 
 		 414 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2975  Radical SAM domain protein  41.6 
 
 		 414 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.0745419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3469  radical SAM family protein  40.16 
 
 		 406 aa  276  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2258  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.36 
 
 		 414 aa  275  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.231457  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2067  radical SAM family protein  38.21 
 
 		 411 aa  275  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.408571  normal  0.630296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0124  radical SAM family protein  39.68 
 
 		 431 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0282893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3329  radical SAM domain-containing protein  38.96 
 
 		 431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0176  radical SAM domain-containing protein  41.98 
 
 		 413 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0668  Radical SAM domain protein  39.28 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.332892  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1787  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 		 422 aa  272  7e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3695  Radical SAM domain protein  39.53 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000234809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2305  radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146682  hitchhiker  0.00602825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2580  radical SAM domain-containing protein  40.32 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0925  helix-hairpin-helix motif  39.1 
 
 		 425 aa  269  5e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000510341 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0826  radical SAM family protein  39.63 
 
 		 422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.243039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2260  radical SAM domain-containing protein  38.23 
 
 		 406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249916  normal  0.262865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0108  Radical SAM domain protein  39.1 
 
 		 429 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3540  radical SAM domain-containing protein  39.58 
 
 		 403 aa  268  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7467  hypothetical protein  39.43 
 
 		 410 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3382  radical SAM domain-containing protein  39.95 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6622  radical SAM domain-containing protein  36.58 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01933  Radical SAM  39.74 
 
 		 413 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1202  Radical SAM domain protein  41.27 
 
 		 418 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000160208  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2262  Radical SAM domain protein  39.79 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.275727 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15350  predicted DNA-binding protein with the helix-hairpin-helix motif  38.83 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000164569  normal  0.0902203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2501  radical SAM family protein  37.66 
 
 		 409 aa  265  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152187  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4606  radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 		 410 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1713  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00398016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03047  elongator protein 3/MiaB/NifB  37.22 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4056  Radical SAM domain protein  40.21 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0681  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 		 370 aa  263  4e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0554713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0251  radical SAM domain-containing protein  40.93 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.996674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3584  radical SAM family protein  40 
 
 		 413 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2234  DNA-binding protein  37.6 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.62693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0909  radical SAM domain-containing protein  37.34 
 
 		 406 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338541  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1154  radical SAM family protein  36.32 
 
 		 502 aa  259  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.848409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4594  radical SAM domain-containing protein  35.02 
 
 		 434 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09110  predicted DNA-binding protein with the helix-hairpin-helix motif protein  36.79 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.567211  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1155  Radical SAM domain protein  40.27 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00303248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4849  radical SAM domain-containing protein  36.54 
 
 		 439 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12078  hypothetical protein  38.86 
 
 		 420 aa  249  6e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2040  radical SAM family protein  37.34 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1336  hypothetical protein  36 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00270043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0388  radical SAM domain-containing protein  35.75 
 
 		 400 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1032  hypothetical protein  36.59 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1942  hypothetical protein  40.15 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0818  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 		 539 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0496  radical SAM family protein  37.77 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  32.12 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  26.89 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35.38 
 
 		 181 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.85 
 
 		 181 aa  50.4  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  21.68 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  43.86 
 
 		 206 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1000  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.14 
 
 		 207 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  21.36 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1233  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  53.33 
 
 		 171 aa  46.6  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2104  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.32 
 
 		 201 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  23.42 
 
 		 367 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0510  hypothetical protein  40.35 
 
 		 134 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0596  hypothetical protein  40.35 
 
 		 134 aa  45.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.368264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  20.69 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  44.23 
 
 		 543 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  23.85 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>