81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09110 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09110  predicted DNA-binding protein with the helix-hairpin-helix motif protein  100 
 
 		 483 aa  1004    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.567211  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1154  radical SAM family protein  67.27 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.848409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15350  predicted DNA-binding protein with the helix-hairpin-helix motif  64.09 
 
 		 434 aa  578  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000164569  normal  0.0902203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3695  Radical SAM domain protein  59.24 
 
 		 435 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000234809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0407  radical SAM family protein  54.35 
 
 		 435 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0124  radical SAM family protein  55.77 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0282893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0496  radical SAM family protein  51.18 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3329  radical SAM domain-containing protein  54.35 
 
 		 431 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0108  Radical SAM domain protein  53.51 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1282  radical SAM domain-containing protein  50.96 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1926  Radical SAM domain protein  51.78 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000517647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05010  Radical SAM domain protein  52.06 
 
 		 415 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1155  Radical SAM domain protein  52.03 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00303248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0246  hypothetical protein  51.42 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1724  Radical SAM domain protein  47.87 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.408853  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0668  Radical SAM domain protein  49.2 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.332892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3382  radical SAM domain-containing protein  54.94 
 
 		 428 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0228  hypothetical protein  51.14 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0306  hypothetical protein  52.35 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0320  hypothetical protein  52.66 
 
 		 419 aa  421  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2639  hypothetical protein  52.66 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4056  Radical SAM domain protein  49.05 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1202  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000160208  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0194  Radical SAM domain protein  48.99 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1575  hypothetical protein  52.04 
 
 		 420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00249963  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12078  hypothetical protein  47.84 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0925  helix-hairpin-helix motif  48.21 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000510341 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0393  Radical SAM domain protein  47.26 
 
 		 397 aa  401  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00226682  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0176  radical SAM domain-containing protein  49.74 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1787  radical SAM domain-containing protein  50.64 
 
 		 422 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0347  hypothetical protein  50.35 
 
 		 420 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0826  radical SAM family protein  50.26 
 
 		 422 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.243039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2984  hypothetical protein  50 
 
 		 412 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0923725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2258  Elongator protein 3/MiaB/NifB  50.13 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.231457  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2003  Radical SAM domain protein  49.62 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1900  radical SAM family protein  49.5 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.308107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2067  radical SAM family protein  46.76 
 
 		 411 aa  363  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.408571  normal  0.630296 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7467  hypothetical protein  47.13 
 
 		 410 aa  358  8e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1759  radical SAM family protein  47.65 
 
 		 411 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03047  elongator protein 3/MiaB/NifB  46.73 
 
 		 414 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2501  radical SAM family protein  46.17 
 
 		 409 aa  352  8e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3540  radical SAM domain-containing protein  45.67 
 
 		 403 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2260  radical SAM domain-containing protein  47.12 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249916  normal  0.262865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6622  radical SAM domain-containing protein  46.27 
 
 		 404 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4606  radical SAM domain-containing protein  46.88 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2714  Radical SAM domain protein  45.17 
 
 		 414 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2975  Radical SAM domain protein  45.96 
 
 		 414 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.0745419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2338  Radical SAM domain protein  45.21 
 
 		 402 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278935  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2262  Radical SAM domain protein  46.25 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.275727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2305  radical SAM domain-containing protein  45.69 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146682  hitchhiker  0.00602825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2234  DNA-binding protein  45.78 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.62693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2580  radical SAM domain-containing protein  45.69 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0909  radical SAM domain-containing protein  45.78 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338541  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4594  radical SAM domain-containing protein  46.45 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2924  radical SAM domain protein  46.17 
 
 		 416 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01933  Radical SAM  45 
 
 		 413 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1192  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.052698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2852  radical SAM domain-containing protein  45.68 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4146  radical SAM domain-containing protein  44.8 
 
 		 403 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2040  radical SAM family protein  43.2 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1309  radical SAM domain-containing protein  45.09 
 
 		 423 aa  329  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4849  radical SAM domain-containing protein  48.9 
 
 		 439 aa  329  7e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2768  radical SAM domain-containing protein  45.66 
 
 		 406 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.723195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3469  radical SAM family protein  42.96 
 
 		 406 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2123  radical SAM domain-containing protein  45.3 
 
 		 406 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0767294  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2365  radical SAM family protein  43.11 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229751  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3584  radical SAM family protein  44.75 
 
 		 413 aa  322  7e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1942  hypothetical protein  54.08 
 
 		 298 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0681  radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 		 370 aa  296  7e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0554713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1713  Radical SAM domain protein  41.52 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00398016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0818  radical SAM domain-containing protein  60.3 
 
 		 539 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1798  Radical SAM domain protein  36.79 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0702083  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1336  hypothetical protein  35 
 
 		 379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00270043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4389  radical SAM domain-containing protein  36 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3729  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2166  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.978798  hitchhiker  0.00000549931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1467  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0281391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0251  radical SAM domain-containing protein  32.51 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.996674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0388  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1032  hypothetical protein  31.23 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  26.47 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>