81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1032 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1032  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  728    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0388  radical SAM domain-containing protein  47.52 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0251  radical SAM domain-containing protein  39.21 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.996674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1336  hypothetical protein  32.79 
 
 		 379 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00270043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1798  Radical SAM domain protein  36.59 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0702083  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3729  radical SAM domain-containing protein  39.46 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2166  radical SAM domain-containing protein  35.93 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.978798  hitchhiker  0.00000549931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4389  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1467  radical SAM domain-containing protein  37.11 
 
 		 386 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0281391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0194  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1787  radical SAM domain-containing protein  33.23 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12078  hypothetical protein  33.42 
 
 		 420 aa  162  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1759  radical SAM family protein  34.05 
 
 		 411 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0246  hypothetical protein  33.84 
 
 		 420 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0228  hypothetical protein  35.44 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0306  hypothetical protein  33.73 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825598  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0176  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 413 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1202  Radical SAM domain protein  34.56 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000160208  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1282  radical SAM domain-containing protein  34.88 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0347  hypothetical protein  33.72 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0393  Radical SAM domain protein  33.76 
 
 		 397 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00226682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0407  radical SAM family protein  30.63 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162852  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0826  radical SAM family protein  32.25 
 
 		 422 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.243039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05010  Radical SAM domain protein  33.44 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2984  hypothetical protein  34.14 
 
 		 412 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0923725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0320  hypothetical protein  34.23 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0108  Radical SAM domain protein  33.84 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1192  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.12 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.052698  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2067  radical SAM family protein  32 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.408571  normal  0.630296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3329  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 		 431 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1926  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000517647  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1155  Radical SAM domain protein  32.54 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00303248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2003  Radical SAM domain protein  31.2 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1575  hypothetical protein  33.14 
 
 		 420 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00249963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1900  radical SAM family protein  31.75 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.308107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2258  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.07 
 
 		 414 aa  149  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.231457  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4056  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2338  Radical SAM domain protein  33.44 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278935  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2501  radical SAM family protein  33.14 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152187  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0668  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.332892  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7467  hypothetical protein  32.42 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03047  elongator protein 3/MiaB/NifB  33.33 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4146  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3382  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 428 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2365  radical SAM family protein  32.07 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229751  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0925  helix-hairpin-helix motif  31.78 
 
 		 425 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000510341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2262  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.275727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2305  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146682  hitchhiker  0.00602825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3540  radical SAM domain-containing protein  34.73 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2580  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09110  predicted DNA-binding protein with the helix-hairpin-helix motif protein  31.23 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.567211  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1724  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.408853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6622  radical SAM domain-containing protein  33.63 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2123  radical SAM domain-containing protein  31.04 
 
 		 406 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0767294  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1309  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 		 423 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0124  radical SAM family protein  34.03 
 
 		 431 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0282893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1713  Radical SAM domain protein  32.79 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00398016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01933  Radical SAM  31.58 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15350  predicted DNA-binding protein with the helix-hairpin-helix motif  30.81 
 
 		 434 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000164569  normal  0.0902203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3469  radical SAM family protein  31.25 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2040  radical SAM family protein  33.68 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4849  radical SAM domain-containing protein  34.44 
 
 		 439 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0909  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338541  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2852  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2768  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.723195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2924  radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2260  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249916  normal  0.262865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2234  DNA-binding protein  32.42 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.62693  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4606  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 		 410 aa  135  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0681  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0554713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3695  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000234809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1154  radical SAM family protein  30.21 
 
 		 502 aa  133  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.848409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3584  radical SAM family protein  31.09 
 
 		 413 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2714  Radical SAM domain protein  32.89 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4594  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2975  Radical SAM domain protein  32.78 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.0745419 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1942  hypothetical protein  32.2 
 
 		 298 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0818  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 		 539 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0496  radical SAM family protein  30.98 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 283 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>