64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0756 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  664    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  55.21 
 
 		 327 aa  348  9e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  54.55 
 
 		 331 aa  346  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  54.71 
 
 		 331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  53.92 
 
 		 330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  51.24 
 
 		 322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  41.46 
 
 		 343 aa  255  9e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  45.17 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  43.6 
 
 		 323 aa  238  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  42.28 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  43.16 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.75 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  22.27 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.12 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  22.27 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 370 aa  53.9  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  23.48 
 
 		 380 aa  52.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.48 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 283 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  21.2 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.22 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2257  radical SAM family Fe-S protein  21.45 
 
 		 446 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.452543  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  22 
 
 		 359 aa  49.3  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  22.16 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  20.08 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  27.22 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  27.22 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  21.4 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.22 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0844  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 421 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.757233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.15 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  20.63 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  24.06 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.77 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  21.18 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.84 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1787  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  20.62 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.42 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  27.22 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 554 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.2 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.21 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  25.57 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  24.32 
 
 		 524 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.64 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  27.55 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0308  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.85 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.91 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.52 
 
 		 312 aa  42.7  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  26.52 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>