53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0919 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  100 
 
 
308 aa  633    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 
283 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  35.43 
 
 
295 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 
355 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 
296 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
290 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  34.59 
 
 
310 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 
351 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  29.5 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  31.99 
 
 
266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  29.85 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 
378 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  29.75 
 
 
378 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  29.54 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 
366 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 
371 aa  106  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 
322 aa  63.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0756  hypothetical protein  28.19 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000116616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
323 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  25.24 
 
 
330 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  25.37 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 
331 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0881  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.4 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659843  hitchhiker  0.00030609 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 
370 aa  46.6  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0399  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.5 
 
 
337 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245923  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 
371 aa  46.2  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4867  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.04 
 
 
334 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 
368 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  27.31 
 
 
321 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  25.89 
 
 
323 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.5 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.42 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.26 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  24.06 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.81 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 
378 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  24.21 
 
 
362 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1581  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.77 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0308  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.35 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4622  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, N-terminus  22.95 
 
 
252 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 
329 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.95 
 
 
337 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4556  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.95 
 
 
337 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  23.53 
 
 
343 aa  42.7  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>