294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1508 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  550  1e-155  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  32.21 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  32.32 
 
 		 308 aa  135  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 351 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 355 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  26.16 
 
 		 349 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 383 aa  95.5  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 390 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 371 aa  85.9  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 378 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 378 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 366 aa  85.5  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.42 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  24.74 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.57 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  25.11 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  24.87 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  22.67 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  26.13 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3236  biotin synthase  27.72 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2257  biotin synthase  25.26 
 
 		 336 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148943  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  23.38 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  26.5 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  27.4 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  27.27 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  26.32 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  29.15 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  29.15 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1861  putative biotin synthase  25.23 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  25.38 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  26.76 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1222  biotin synthase  27.46 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  23.04 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  23.62 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  29.56 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  26.94 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2150  biotin synthase  24.77 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  22.27 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  26.29 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  26.48 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  28.04 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  28.57 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  27.8 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  22.84 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  22.84 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  25.98 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  27.46 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  27.27 
 
 		 367 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  25.93 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  25.36 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  24.22 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  27.42 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  22.28 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  22.56 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  25.12 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30955  Biotin synthase  24.1 
 
 		 361 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0547155 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  21.94 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  21.94 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  23 
 
 		 345 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  25.93 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  25.93 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  25.93 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0618  biotin synthase  26.32 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.743089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  25.93 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  25.93 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  25.93 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  23.04 
 
 		 339 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  23.35 
 
 		 324 aa  53.1  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  25.11 
 
 		 350 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 351 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  26.88 
 
 		 345 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  24.62 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  24.37 
 
 		 324 aa  52.8  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  23.9 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  23.38 
 
 		 375 aa  53.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2097  biotin synthase  24.43 
 
 		 347 aa  52.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  25.67 
 
 		 354 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  25.93 
 
 		 332 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  24.88 
 
 		 328 aa  52.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 377 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  23.59 
 
 		 326 aa  52.8  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 356 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  24.88 
 
 		 346 aa  52.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>