116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2088 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 351 aa  729    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  76.37 
 
 		 355 aa  563  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  38.41 
 
 		 349 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  34.19 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  35.15 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  34.17 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  34.41 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  34.41 
 
 		 378 aa  212  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  36.1 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 295 aa  109  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  22.36 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  22.36 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  24.6 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  24.07 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  25.29 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  23.59 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  29.46 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30955  Biotin synthase  22.58 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0547155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  21.68 
 
 		 368 aa  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  21.99 
 
 		 350 aa  49.7  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  23.41 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  23.35 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  22.69 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  25.1 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  23.83 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  23.89 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  22.13 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  22.92 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  26 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  22.92 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  23.29 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  23.46 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  23.46 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  23.46 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  22.92 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  21.74 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  23.46 
 
 		 322 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.1 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  23.37 
 
 		 339 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  21.79 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  23.46 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  23.46 
 
 		 336 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  22.13 
 
 		 311 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  23.85 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  22.49 
 
 		 331 aa  46.2  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  25.52 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.05 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  24.9 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  24.9 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 544 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  21.34 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  22.4 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  23.72 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  24.11 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  21.34 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  21.34 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  21.34 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3779  biotin synthase  26.42 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195072  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  21.34 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  25.7 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  23.72 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  24.11 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  21.4 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.57 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  26.92 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  23.58 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  22.57 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  21.69 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  24.31 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  23.08 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  23.32 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4389  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  22.09 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  22.09 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  23.08 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  20.34 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  24.29 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  21.4 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  22.85 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  22.57 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  22.67 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  24.6 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  27.34 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2132  biotin synthase  23.51 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>