More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2161 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1067  lysyl-tRNA synthetase  73.28 
 
 		 492 aa  771    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.433368  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1187  lysyl-tRNA synthetase  70.06 
 
 		 493 aa  730    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0922785  hitchhiker  0.00801016 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2161  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 496 aa  1017    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000571826 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0619  lysyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0707  lysyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 486 aa  421  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.282019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1755  lysyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 482 aa  418  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 515 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0499  lysyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 482 aa  412  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0771  lysyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 482 aa  412  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0292263  normal  0.277494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 502 aa  405  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 514 aa  405  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 499 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 489 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 583 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 490 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 573 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 573 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 491 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 573 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 502 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 510 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 515 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 496 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 489 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 515 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 502 aa  385  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 561 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 577 aa  385  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 523 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 563 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1242  lysyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 495 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 1118 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 497 aa  382  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 647 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 515 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 562 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 508 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1559  lysyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 573 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 491 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 631 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 498 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  41.7 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.18 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 488 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 503 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  42.3 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  42.3 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 508 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>