More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2496 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  64.1 
 
 		 508 aa  648    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 		 514 aa  665    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 505 aa  1036    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  61.95 
 
 		 511 aa  637    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  61.57 
 
 		 515 aa  619  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 490 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 573 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 573 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 573 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 493 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  49.28 
 
 		 491 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 504 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 494 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 489 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 492 aa  461  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 491 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 495 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 631 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 492 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 502 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 515 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 515 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 502 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 513 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 505 aa  449  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 512 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 512 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 499 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 502 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1556  lysyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6390  lysyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 583 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 505 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 497 aa  445  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0424  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0159622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 502 aa  445  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 489 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 512 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 513 aa  442  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 647 aa  441  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 502 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 505 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 507 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 505 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 494 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1187  lysyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0922785  hitchhiker  0.00801016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  45.05 
 
 		 505 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1067  lysyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 492 aa  435  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.433368  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  45.05 
 
 		 505 aa  438  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3052  lysyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 527 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 505 aa  438  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 577 aa  438  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 503 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>