More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0499 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0771  lysyl-tRNA synthetase  87.53 
 
 		 482 aa  883    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0292263  normal  0.277494 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0499  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 482 aa  975    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0707  lysyl-tRNA synthetase  90.62 
 
 		 486 aa  902    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.282019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1755  lysyl-tRNA synthetase  87.11 
 
 		 482 aa  882    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1187  lysyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 493 aa  443  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0922785  hitchhiker  0.00801016 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1067  lysyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 492 aa  434  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.433368  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2161  lysyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 496 aa  412  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000571826 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0619  lysyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 480 aa  383  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0202309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2496  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 502 aa  372  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 502 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2116  lysyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 501 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 499 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 494 aa  355  8.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 1118 aa  351  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 489 aa  350  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 573 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 489 aa  346  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 573 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 501 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 573 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 499 aa  342  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 501 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 499 aa  340  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 491 aa  339  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 499 aa  339  8e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 499 aa  339  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 499 aa  339  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 647 aa  338  9.999999999999999e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 493 aa  336  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 508 aa  336  5.999999999999999e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 498 aa  335  7e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 502 aa  335  7e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 499 aa  336  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 561 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 631 aa  333  3e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 513 aa  333  5e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 503 aa  332  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2366  lysyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 522 aa  333  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 488 aa  332  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 489 aa  332  8e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  37.3 
 
 		 498 aa  332  9e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 523 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1919  lysyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 567 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 507 aa  331  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 510 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  37.58 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1559  lysyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 573 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 508 aa  329  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 512 aa  329  8e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 492 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 505 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 507 aa  327  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 494 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 497 aa  326  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 511 aa  326  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0503  lysyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 504 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0578  lysyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 498 aa  324  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.873191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 494 aa  323  3e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1681  lysyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 491 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 502 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 515 aa  320  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 507 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 563 aa  319  7e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 499 aa  318  1e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>