More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2366 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2366  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 522 aa  1080    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 		 509 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 573 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 573 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 508 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 561 aa  465  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 504 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 573 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 499 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 499 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 499 aa  448  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 494 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 504 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 499 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 515 aa  445  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 491 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 515 aa  445  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 510 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 488 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 488 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 513 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 513 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 501 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 501 aa  435  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 493 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  45.07 
 
 		 496 aa  435  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 499 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 631 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  45.83 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 489 aa  425  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2331  lysyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 523 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1675  lysyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  44.16 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  42.86 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 647 aa  406  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  44.16 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  42.86 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 502 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>