More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0726 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
507 aa  1043    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 
510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
491 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 
499 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  51.95 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
505 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  51.95 
 
 
505 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
505 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
493 aa  538  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
491 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
488 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  52.78 
 
 
491 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
505 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 
499 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
505 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
513 aa  525  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
494 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  51.17 
 
 
505 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
505 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
505 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  51.17 
 
 
505 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
505 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
505 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
505 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
505 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
505 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
501 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
505 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
505 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
505 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
505 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
494 aa  520  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
505 aa  520  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
505 aa  521  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
496 aa  521  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 
492 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
494 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
505 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 
505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 
505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 
503 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
495 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
499 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
492 aa  511  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
499 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
499 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
499 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 
494 aa  514  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
499 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
489 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
499 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
499 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
495 aa  512  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
505 aa  509  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 
492 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
515 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 
499 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
489 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
494 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
502 aa  509  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 
499 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
515 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
499 aa  510  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
501 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
503 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
507 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 
499 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 
490 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
484 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
499 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
509 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
523 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
511 aa  496  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
511 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  50.82 
 
 
496 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
508 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  50.61 
 
 
501 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
524 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 
497 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
514 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
508 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  50.72 
 
 
496 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
514 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
561 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
504 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 
515 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
508 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
508 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
501 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
508 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 
508 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
508 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1204  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.325374  normal  0.0127653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>