110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1374 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 401 aa  822    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  40.05 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  34.01 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  34.4 
 
 		 386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  29.23 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  29.38 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  32.25 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  26.84 
 
 		 418 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  28.08 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  29.59 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  29.11 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  28.78 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  26.15 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  28.78 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  26.49 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  26.49 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  28.9 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  26.63 
 
 		 427 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  28.16 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  26.57 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  35.32 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  26.57 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  28.9 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  26.21 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  26.7 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  38.81 
 
 		 375 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  28.82 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  30.62 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  30.04 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  28.92 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  27.08 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  28.07 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  27.38 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  26.84 
 
 		 410 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  25.84 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  26.7 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  26.83 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  27.23 
 
 		 460 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  26.23 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  32.14 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  26.12 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  28.43 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  26.37 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  26.87 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  26.77 
 
 		 407 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  26.17 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  29.97 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  26.61 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  38.61 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  29.73 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  25.26 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  29.81 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  36.02 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  25.93 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  30.46 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  32.83 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  30.15 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  24.69 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  29.35 
 
 		 398 aa  93.2  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  27.84 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  32.02 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  36.46 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  36.46 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  36.46 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  27.71 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  26.9 
 
 		 479 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  27.37 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  31.38 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  30.15 
 
 		 370 aa  86.3  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  26.68 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  28.03 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  25 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  27.18 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  28.28 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  24.8 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  25.73 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  25.62 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  27.59 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  28.4 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  25.91 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  25 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  22.89 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  24.38 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  23.5 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  27.27 
 
 		 480 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  27.27 
 
 		 480 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  27.27 
 
 		 480 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  24.07 
 
 		 512 aa  53.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  21.12 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  27.22 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  26.79 
 
 		 480 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  26.83 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  26.04 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  24.23 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  26.21 
 
 		 462 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  29.06 
 
 		 482 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  26.22 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  26.71 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  32.47 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  26.55 
 
 		 508 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>