112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1291 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  100 
 
 
418 aa  835    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  63.02 
 
 
429 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  58.69 
 
 
395 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  57.68 
 
 
394 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  54.36 
 
 
401 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  53.63 
 
 
405 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  54.1 
 
 
400 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  52.14 
 
 
408 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  52.47 
 
 
414 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  56.15 
 
 
403 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  53.37 
 
 
405 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  51.9 
 
 
410 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  50.61 
 
 
427 aa  362  6e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  53.32 
 
 
398 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  52.81 
 
 
398 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  51.79 
 
 
398 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  51.32 
 
 
407 aa  349  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  49 
 
 
403 aa  343  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  48.48 
 
 
420 aa  342  5.999999999999999e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  51.96 
 
 
421 aa  332  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  49.09 
 
 
419 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  51.42 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  45.29 
 
 
404 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  42.79 
 
 
460 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  43.26 
 
 
459 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  44.02 
 
 
409 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  42.67 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  43.18 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  42.67 
 
 
410 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  42.35 
 
 
428 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  43.41 
 
 
401 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  41.96 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  42.82 
 
 
410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  42.89 
 
 
407 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  42.04 
 
 
389 aa  269  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  40.36 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  36.06 
 
 
415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  37.4 
 
 
394 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  37.72 
 
 
404 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  37.56 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  36.48 
 
 
424 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  37.34 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  35.94 
 
 
375 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  37.4 
 
 
415 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  35.19 
 
 
379 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  36.02 
 
 
404 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  33.68 
 
 
379 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  35.11 
 
 
364 aa  170  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  33.78 
 
 
386 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  33.16 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  35.93 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  35.01 
 
 
371 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  32.82 
 
 
389 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  32.9 
 
 
398 aa  159  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  32.23 
 
 
370 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  32.01 
 
 
377 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  33.07 
 
 
419 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  27.98 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  39.18 
 
 
364 aa  122  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  26.84 
 
 
401 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  32.07 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  30.85 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  30.85 
 
 
422 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  30.85 
 
 
422 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.31 
 
 
401 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  35.89 
 
 
372 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  27.72 
 
 
400 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  28.24 
 
 
392 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  35.21 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  26.64 
 
 
444 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  25.57 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  27.03 
 
 
456 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  27.83 
 
 
460 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  23.87 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  29.94 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  29.48 
 
 
342 aa  69.7  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  28.57 
 
 
445 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  28.15 
 
 
481 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  27.17 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  25.84 
 
 
458 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  28.23 
 
 
492 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  29.31 
 
 
482 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  29.57 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  31.37 
 
 
456 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  33.66 
 
 
444 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  30.77 
 
 
475 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  29.03 
 
 
482 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  32.11 
 
 
466 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  29.13 
 
 
447 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  29.11 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  23.79 
 
 
462 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  27.19 
 
 
508 aa  56.6  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  26.74 
 
 
480 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  26.74 
 
 
480 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  26.74 
 
 
480 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  26.54 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  27.68 
 
 
512 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  28.45 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  27.6 
 
 
507 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  30.74 
 
 
484 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>