99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0718 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  89.61 
 
 		 462 aa  800    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  74.68 
 
 		 458 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  85.53 
 
 		 463 aa  769    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  100 
 
 		 460 aa  932    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  43.31 
 
 		 481 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  38.79 
 
 		 456 aa  292  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  29.25 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  31.52 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  29.88 
 
 		 462 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  31.91 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  30.59 
 
 		 475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  30.57 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  32.14 
 
 		 482 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  30.27 
 
 		 478 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  30.69 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  30.47 
 
 		 512 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  30.12 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  30.27 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  30.27 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  30.27 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  28.18 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  30.02 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  28.85 
 
 		 508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  33.26 
 
 		 484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  30.48 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  31.44 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  26.1 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  29.93 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  35.71 
 
 		 507 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  25.43 
 
 		 482 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  39.92 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  32.76 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  37.92 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  38.53 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  29.7 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  25.41 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  27.13 
 
 		 453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  23.59 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  28.63 
 
 		 489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  24.9 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  28.71 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  30.22 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  33.17 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  35.8 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  30.49 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  31.1 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  29.47 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  27.45 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  27.4 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  31.63 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  27.83 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  31.16 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.82 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  31.25 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  31.31 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  30.08 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  32.03 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  24.53 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  27.23 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  32.76 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.92 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  29.91 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  31.93 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  29.76 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  29.52 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  30.29 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  29.61 
 
 		 394 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  31.33 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  30.05 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  30.06 
 
 		 407 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  30.72 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  29.33 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  29.79 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  26.61 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  28.99 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  30.91 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  30.24 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  28.93 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  26.37 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  28.78 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  31.28 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  31.28 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  28.15 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  25 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  30.43 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  24.3 
 
 		 389 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  27.72 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  25.79 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  30.06 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  30.05 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  29.81 
 
 		 375 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  28.84 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  29.58 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  27.59 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  30.09 
 
 		 415 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  23.47 
 
 		 404 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  27.16 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  43.94 
 
 		 466 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>