90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0779 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 512 aa  1033    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  51.66 
 
 		 508 aa  512  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  53.19 
 
 		 507 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  30.06 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  32.24 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  43.43 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  32.78 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  34.05 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  32.11 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  37.71 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  31.91 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  34.23 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  31.58 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  34.03 
 
 		 482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  28.42 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  37.5 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  37.5 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  35.9 
 
 		 456 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  39.83 
 
 		 466 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  29.17 
 
 		 492 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  38.1 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  38.1 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  38.1 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  36.7 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  34.31 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  34.38 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  37.04 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  36.32 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  34.13 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  32.84 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  35.6 
 
 		 480 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  31.51 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  34.21 
 
 		 469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  33.47 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  31.37 
 
 		 462 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  34.05 
 
 		 455 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  34.07 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  34.65 
 
 		 475 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  23.43 
 
 		 479 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  25 
 
 		 468 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  28.07 
 
 		 444 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  30.94 
 
 		 489 aa  93.2  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  24.58 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  36.96 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  33.33 
 
 		 377 aa  70.1  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  27.7 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  31.61 
 
 		 380 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  28.87 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  28.57 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  29.38 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  31.74 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  29.02 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  29.03 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  29.44 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  25.58 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  32.12 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  29.09 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.35 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  29.6 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  27.53 
 
 		 401 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  31.31 
 
 		 393 aa  57  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  27.67 
 
 		 364 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  27.68 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  24.07 
 
 		 401 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  26.52 
 
 		 405 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  30.36 
 
 		 370 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  25.89 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  27.07 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  28.33 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  28.49 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  27.53 
 
 		 398 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  27.53 
 
 		 398 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  30.94 
 
 		 404 aa  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  26.06 
 
 		 407 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  25.89 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  30.98 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  21.96 
 
 		 342 aa  49.3  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  25.39 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  27.22 
 
 		 405 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  29.19 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  28.09 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  25.11 
 
 		 410 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  25.11 
 
 		 410 aa  47.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  26.57 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  30.72 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  25.7 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  24.62 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  27.54 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  27.88 
 
 		 379 aa  43.9  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  28.97 
 
 		 419 aa  43.9  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>