113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0472 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 403 aa  798    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  51.3 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  51.04 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  52.33 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  49.62 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  49 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  51.42 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  49.62 
 
 		 408 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  51.42 
 
 		 410 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  50.88 
 
 		 395 aa  349  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  54.81 
 
 		 403 aa  348  8e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  49.62 
 
 		 400 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  50.77 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  49.75 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  51.01 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  50.78 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  46.95 
 
 		 420 aa  325  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  48.74 
 
 		 398 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  48.14 
 
 		 427 aa  322  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  48.04 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  47.78 
 
 		 410 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  48.94 
 
 		 393 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  46.21 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  46.31 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  47.57 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  48.33 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  44.44 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  45.53 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  44.85 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  44.9 
 
 		 428 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  42.53 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  41.92 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  43.65 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  39.85 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  42.32 
 
 		 407 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  32.74 
 
 		 415 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  35.88 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  38.56 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  39.05 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  36.1 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  37.17 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  36.02 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  34.51 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  35.54 
 
 		 375 aa  176  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  36.22 
 
 		 370 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  36.61 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  41.91 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  34.29 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  35.28 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  32.98 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  34.67 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  33.51 
 
 		 395 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  33.15 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  33.6 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  43.56 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  30.33 
 
 		 393 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  33.43 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.93 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  31.1 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  33.8 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  32.21 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  33.43 
 
 		 372 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  38.58 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  31.58 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  28.82 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  36.36 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  36.36 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  35.81 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  35.32 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  25.6 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  23.94 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  24.29 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  28.16 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  25.97 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  26.94 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  30.56 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  25.62 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  27.49 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  26.83 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  27.06 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  26.96 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  26.47 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  24.72 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  30.23 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  22.25 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  23.25 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  27.15 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  25.24 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  25.09 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  31.55 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  26.47 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  26.41 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  29.56 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  28.36 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  26.76 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  27.67 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  29.38 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  29.09 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>