120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1214 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 392 aa  774    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  62.09 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  37.94 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  38.16 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  36.27 
 
 		 400 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  35.84 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  32.72 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  36 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  32.45 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  31.32 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  29.55 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  32.19 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  33.68 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  35.17 
 
 		 393 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  31.44 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  30.05 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  31.32 
 
 		 428 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  32.53 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  31.33 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  26.61 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  30.32 
 
 		 405 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  30.37 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  29.92 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  29.95 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  30.47 
 
 		 460 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  32.16 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  29.26 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  32.09 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  29.87 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  29.74 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  32.16 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  36.31 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  31.7 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  29.54 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  32.03 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  30.32 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  30.38 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  31.82 
 
 		 379 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  32.29 
 
 		 415 aa  137  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  28.61 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  28.97 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  32.37 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  31.76 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  38.67 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  33.57 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  34.75 
 
 		 420 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  34.03 
 
 		 424 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  32.09 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  39.5 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  35.97 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  33.68 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  31.47 
 
 		 364 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  29.71 
 
 		 394 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  29.87 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  30 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  33.33 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  29.87 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  30.26 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  36.5 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  32.34 
 
 		 444 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  29.72 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  31.53 
 
 		 370 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  32.64 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  35.75 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  36.24 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  34.76 
 
 		 453 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  26.8 
 
 		 479 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  39.13 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  39.13 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  39.13 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  35.87 
 
 		 460 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  31.09 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  35.33 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  34.36 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  26.32 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  27.59 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  25.24 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  35.48 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  36.65 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  34.67 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  29.32 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  27.12 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  28.82 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  30.15 
 
 		 492 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  35.58 
 
 		 475 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  25.39 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  31.34 
 
 		 512 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  29.02 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  33.13 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  30.67 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  33.33 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  30.54 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  29.05 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  35.75 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  28.99 
 
 		 482 aa  62.8  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  32.84 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  33.5 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  32.84 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>