98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0211 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  100 
 
 
414 aa  774    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  40.84 
 
 
401 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  33.42 
 
 
393 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  34.79 
 
 
409 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  38.4 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  34.89 
 
 
386 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  31.1 
 
 
405 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  32.01 
 
 
428 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  30.1 
 
 
401 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  31.4 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  32.1 
 
 
405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  32.32 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  36.66 
 
 
377 aa  139  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  30.64 
 
 
414 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  30.77 
 
 
408 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  26.58 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  31.39 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  31.44 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  31.95 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  31.95 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  37.34 
 
 
393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  34.65 
 
 
380 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  32.39 
 
 
403 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  33.33 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  30.38 
 
 
405 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  31.37 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  31.03 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  32.66 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  30.88 
 
 
407 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  32.67 
 
 
411 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  32.6 
 
 
410 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  30.48 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  32.46 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  29.14 
 
 
427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  31.1 
 
 
400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  34.01 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  32.03 
 
 
379 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  32 
 
 
429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  33.68 
 
 
403 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  31.28 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  33.84 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  33.07 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  31.37 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  39.6 
 
 
389 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  39.18 
 
 
364 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  31.36 
 
 
395 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  30.96 
 
 
398 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  41.63 
 
 
364 aa  106  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  33.33 
 
 
395 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  30.42 
 
 
404 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  30.42 
 
 
407 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  37.33 
 
 
370 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  28.82 
 
 
403 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  33.5 
 
 
421 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  32.84 
 
 
422 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  32.84 
 
 
422 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  27.52 
 
 
420 aa  100  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  44.56 
 
 
414 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  32.84 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  40.57 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  36.71 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  31.56 
 
 
394 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  29.9 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  37.06 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  29.41 
 
 
394 aa  89.7  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  39.58 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  32.6 
 
 
424 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  36.84 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  31.98 
 
 
444 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  22.93 
 
 
479 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  35.64 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  27.72 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  27.45 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  26.46 
 
 
460 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  30.43 
 
 
453 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  25.29 
 
 
462 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  28.74 
 
 
462 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  30.98 
 
 
512 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 
476 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  27.8 
 
 
469 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  29.77 
 
 
481 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  29.89 
 
 
460 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  27.95 
 
 
482 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  26.92 
 
 
447 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  28.14 
 
 
458 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  29.81 
 
 
466 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  30.56 
 
 
508 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  25.28 
 
 
456 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  29.31 
 
 
463 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  29.35 
 
 
462 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  24.4 
 
 
492 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  26.52 
 
 
489 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  29.71 
 
 
482 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2171  VWA containing CoxE family protein  32.2 
 
 
552 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  28.32 
 
 
467 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  30.54 
 
 
456 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  20.37 
 
 
468 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  22.91 
 
 
468 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>