109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4355 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  100 
 
 		 459 aa  906    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  86.98 
 
 		 411 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  91.74 
 
 		 460 aa  810    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  68.61 
 
 		 410 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  68.37 
 
 		 410 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  69.49 
 
 		 410 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  69.13 
 
 		 409 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  66.17 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  44.47 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  44.73 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  44.62 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  45.24 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  43.4 
 
 		 418 aa  296  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  43.85 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  46.83 
 
 		 400 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  44.97 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  45.75 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  46.63 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  44.06 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  44.44 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  46.63 
 
 		 421 aa  279  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  44.67 
 
 		 398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  44.92 
 
 		 398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  43.03 
 
 		 427 aa  272  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  43.8 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  39.29 
 
 		 420 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  40.82 
 
 		 419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  44.1 
 
 		 395 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  40.51 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  42.89 
 
 		 393 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  40.95 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  42.82 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  39.9 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  37.72 
 
 		 404 aa  236  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  37.95 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  34.54 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  36.76 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  36.9 
 
 		 389 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  37.22 
 
 		 424 aa  204  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  36.06 
 
 		 414 aa  202  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  35.77 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  36.54 
 
 		 386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  34.66 
 
 		 375 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  34.2 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  35.14 
 
 		 379 aa  167  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  32.31 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  29.62 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  42.8 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  41.36 
 
 		 371 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  34.95 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  33.41 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  34.07 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  34.68 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  33.88 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  33.81 
 
 		 385 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  37.11 
 
 		 419 aa  132  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  38.1 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  43.6 
 
 		 377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  32.75 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  30.45 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  36.88 
 
 		 364 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  36.47 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  29.26 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  32.41 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  26.1 
 
 		 401 aa  99.8  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  28.46 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  28.46 
 
 		 422 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  28.21 
 
 		 422 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  29.81 
 
 		 403 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  27.45 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  26.56 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  24.57 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  31.93 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  30.86 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  31.33 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  23.31 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  29.67 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  23.18 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  28.46 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  29.54 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  27.27 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  31.67 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  26.69 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  26.36 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  29.65 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  27.85 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  26.88 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  26.79 
 
 		 478 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  49.21 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  30.26 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  28.25 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  28.89 
 
 		 475 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  29.7 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  31.55 
 
 		 476 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  38.46 
 
 		 480 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  38.46 
 
 		 480 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  38.46 
 
 		 480 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  28.94 
 
 		 453 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  49.18 
 
 		 466 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  32.54 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>