91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2180 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
466 aa  926    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  68.95 
 
 
456 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  56.14 
 
 
475 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  55.95 
 
 
482 aa  488  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  56.44 
 
 
484 aa  471  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  50.21 
 
 
455 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  43.63 
 
 
480 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  43.63 
 
 
480 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  43.63 
 
 
480 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  42.49 
 
 
480 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  41.25 
 
 
478 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  41.98 
 
 
467 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  41.47 
 
 
477 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  40.46 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  39.14 
 
 
444 aa  244  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  34.2 
 
 
469 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  29.07 
 
 
492 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  29.04 
 
 
460 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  27.99 
 
 
481 aa  166  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  31.18 
 
 
447 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  29.86 
 
 
476 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  30.28 
 
 
458 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  28.69 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  34.87 
 
 
453 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  27.14 
 
 
462 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  29.62 
 
 
460 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  24.57 
 
 
479 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  32.63 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  33.61 
 
 
462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  33.19 
 
 
463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  25.87 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  26.45 
 
 
482 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  38.39 
 
 
466 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  37.43 
 
 
466 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  37.44 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  37.44 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  33.91 
 
 
507 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  33.47 
 
 
512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  33.63 
 
 
508 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  27.39 
 
 
468 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  29.69 
 
 
468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  33.66 
 
 
489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  32.74 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  26.78 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  27.51 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  28.52 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  27.47 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  27.82 
 
 
389 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  30.54 
 
 
405 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  30.29 
 
 
393 aa  61.6  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  29.41 
 
 
401 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  25.51 
 
 
401 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  23.89 
 
 
342 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  27.95 
 
 
419 aa  57  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  29.32 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  29.77 
 
 
403 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  28.64 
 
 
398 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  28.64 
 
 
398 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  25.64 
 
 
427 aa  55.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  22.12 
 
 
415 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  33.62 
 
 
410 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  32.12 
 
 
392 aa  53.5  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  33.62 
 
 
410 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  38.54 
 
 
405 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  27.96 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  30.83 
 
 
393 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  30.09 
 
 
395 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  30.52 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  29.76 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  30.84 
 
 
403 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  37.74 
 
 
405 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3988  VWA containing CoxE family protein  27.46 
 
 
393 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  26.2 
 
 
429 aa  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  37.14 
 
 
414 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5019  VWA containing CoxE family protein  29.2 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  36.19 
 
 
401 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  26.36 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  25.3 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  29.52 
 
 
377 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  29.86 
 
 
401 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  29.5 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  39.68 
 
 
428 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  36.51 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  33.33 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  25.4 
 
 
411 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  29.81 
 
 
364 aa  44.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  32.99 
 
 
394 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  39.02 
 
 
407 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  27.7 
 
 
370 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  25.12 
 
 
459 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 
385 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>