112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5315 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  78.7 
 
 		 405 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  78.7 
 
 		 400 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  78.3 
 
 		 414 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  815    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  77.56 
 
 		 405 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  79.23 
 
 		 410 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  74.74 
 
 		 408 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  54.36 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  53.42 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  53.66 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  49.62 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  50.65 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  50.26 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  52.69 
 
 		 403 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  46.97 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  46.84 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  46.58 
 
 		 398 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  47.33 
 
 		 398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  43.91 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  44.06 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  44.62 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  43.85 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  42.38 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  43.85 
 
 		 419 aa  289  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  43.82 
 
 		 460 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  46.11 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  41.71 
 
 		 410 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  41.71 
 
 		 410 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  46.54 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  42.03 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  40 
 
 		 410 aa  269  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  40.66 
 
 		 389 aa  262  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  39.19 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  37.82 
 
 		 401 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  38.62 
 
 		 407 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  37.37 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  38.34 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  35.34 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  37.24 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  36.95 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  36.54 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  35.79 
 
 		 375 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  35.14 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  35.68 
 
 		 364 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  35.02 
 
 		 370 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  30.77 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  39.51 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  33.16 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  32.97 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  32.55 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  31.27 
 
 		 389 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  32.19 
 
 		 398 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  33.14 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  35.86 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  31.61 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  28.46 
 
 		 393 aa  150  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  30.79 
 
 		 392 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  30.29 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  28.38 
 
 		 377 aa  126  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  27.75 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  31.04 
 
 		 364 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  29.66 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  33.04 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  37.37 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  25.64 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  33.98 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  33.98 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  33.98 
 
 		 422 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  30.88 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  26.94 
 
 		 456 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  28.76 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  27.78 
 
 		 342 aa  72.8  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  24.77 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  29.76 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  27.17 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  29.02 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  29.52 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  28.29 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  24.82 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  28.91 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  27.14 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  22.58 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  26.94 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  26.2 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  22.53 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  23.44 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  21.15 
 
 		 492 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  27.53 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 467 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  23.26 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  24.54 
 
 		 508 aa  56.2  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  22.98 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  28.08 
 
 		 475 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  26.44 
 
 		 456 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  30 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  30 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  30 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  23.47 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  27.78 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>