113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1769 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  100 
 
 		 427 aa  865    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  65.25 
 
 		 420 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  63.83 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  68.67 
 
 		 398 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  68.17 
 
 		 398 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  68.26 
 
 		 398 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  50.61 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  50.71 
 
 		 403 aa  358  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  47.85 
 
 		 407 aa  339  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  50 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  46.97 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  49.75 
 
 		 394 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  46.58 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  47.61 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  46.7 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  50.63 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  50.12 
 
 		 421 aa  322  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  45.18 
 
 		 408 aa  319  5e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  47.24 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  48.14 
 
 		 403 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  47.36 
 
 		 393 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  44.7 
 
 		 410 aa  293  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  42.17 
 
 		 410 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  42.17 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  43.22 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  42.75 
 
 		 410 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  42.86 
 
 		 460 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  43.03 
 
 		 459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  43.04 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  42.38 
 
 		 409 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  43.03 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  38.85 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  39.7 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  39.45 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  39.9 
 
 		 407 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  40.35 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  37.56 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  38.65 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  38.65 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  36.59 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  31.49 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  38.23 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  36.69 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  33.09 
 
 		 379 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  32.74 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  34.38 
 
 		 415 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  34.95 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  33.77 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  33.33 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  32.64 
 
 		 386 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  41.7 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  29 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  33.81 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  33.59 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  31.23 
 
 		 389 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  33.83 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  31.68 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  34.9 
 
 		 364 aa  122  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  28.68 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  26.63 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  28.01 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  35.59 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.09 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  29.56 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  29.56 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  29.56 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.1 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  36.68 
 
 		 372 aa  98.2  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  28.89 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  22.98 
 
 		 342 aa  76.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  29.62 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  27.69 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  22.8 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  27.68 
 
 		 460 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  26.41 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  26.85 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  24.88 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  26.79 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  25.69 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  27.33 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  22.66 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  26.48 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  27.19 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  24.16 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  21.43 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  25.74 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  29.85 
 
 		 484 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  30.18 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  27.42 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  26.44 
 
 		 492 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  25.74 
 
 		 466 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  25.94 
 
 		 462 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  25.93 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  21.7 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  26.03 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  26.36 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  29.58 
 
 		 466 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  28.32 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  28.32 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  28.32 
 
 		 480 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>