112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4713 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 407 aa  798    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  50.65 
 
 		 401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  51.32 
 
 		 418 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  50.79 
 
 		 414 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  50 
 
 		 405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  51.41 
 
 		 398 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  51.15 
 
 		 398 aa  350  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  52.65 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  49.87 
 
 		 400 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  51.31 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  50.79 
 
 		 408 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  47.85 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  51.03 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  50.78 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  50.39 
 
 		 410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  51.59 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  47.49 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  51.05 
 
 		 395 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  45.48 
 
 		 420 aa  315  8e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  49.87 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  48.81 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  46.67 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  47.14 
 
 		 410 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  47.07 
 
 		 410 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  46.63 
 
 		 459 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  46.49 
 
 		 411 aa  288  9e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  45.86 
 
 		 460 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  47.03 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  44.3 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  43.54 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  41.36 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  40.1 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  43.01 
 
 		 405 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  40.37 
 
 		 401 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  39.74 
 
 		 407 aa  225  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  37.96 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  35.16 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  37.31 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  37.31 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  38.3 
 
 		 424 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  37.37 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  36.94 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  36.84 
 
 		 401 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  34.29 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  35.14 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  34.96 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  40.61 
 
 		 404 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  34.1 
 
 		 375 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  33.42 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  39.67 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  33.59 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  34.59 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  38.81 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  32.98 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  38.43 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  32.21 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  37.8 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  34.62 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  37.57 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  26.6 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  34.66 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  33.73 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  31.13 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  36.07 
 
 		 403 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  29.32 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  29.32 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  29.32 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  34.92 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  26.1 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  25.46 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  24.16 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  26.67 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  26 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  28.96 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  31.56 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  32.5 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  25.77 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  24.41 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  30.81 
 
 		 460 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  30.3 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  26.62 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  28.5 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  26.57 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  26.57 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  26.57 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  22.26 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  30 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  28.81 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  26.14 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  26.32 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  30.9 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  27.27 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  29.05 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  26 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  28.17 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  26.45 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  26.92 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  30.23 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  30.98 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  30.98 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>