102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2035 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
415 aa  817    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  52.96 
 
 
404 aa  330  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  42.64 
 
 
380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  40.05 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  41.3 
 
 
379 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  39.59 
 
 
379 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  35.75 
 
 
404 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  40.51 
 
 
370 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  37.53 
 
 
389 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  33.08 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  37.82 
 
 
364 aa  200  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  39.39 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  34.83 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  37.11 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  37.11 
 
 
418 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  37.78 
 
 
398 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  36.68 
 
 
395 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  40.84 
 
 
401 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  32.29 
 
 
407 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  34.18 
 
 
405 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  35.69 
 
 
415 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  33.91 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  33.67 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  37.5 
 
 
403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  32 
 
 
408 aa  179  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  32.13 
 
 
389 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  31.9 
 
 
401 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  37.06 
 
 
395 aa  176  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  37.24 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  34.44 
 
 
427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  36.41 
 
 
394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  37.69 
 
 
375 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  31.94 
 
 
420 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  36.46 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  33.16 
 
 
410 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  33.77 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  30.89 
 
 
400 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  35.95 
 
 
398 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  36.32 
 
 
422 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  36.32 
 
 
422 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  35.95 
 
 
422 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  34.65 
 
 
407 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  35.09 
 
 
411 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  35.48 
 
 
398 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  32.89 
 
 
410 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  32.72 
 
 
410 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  32.34 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  32.17 
 
 
403 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  34.59 
 
 
460 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  34.84 
 
 
459 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  32.98 
 
 
403 aa  150  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  32.91 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  40 
 
 
393 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  33.59 
 
 
410 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  34.64 
 
 
421 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  32.82 
 
 
404 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  40.23 
 
 
364 aa  142  8e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  32.45 
 
 
371 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  37.15 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  31.33 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  32.49 
 
 
424 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  29.49 
 
 
392 aa  113  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  30.96 
 
 
414 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.25 
 
 
400 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  30.05 
 
 
377 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  27.59 
 
 
401 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  31 
 
 
401 aa  97.1  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  33.52 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  29.17 
 
 
342 aa  90.9  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  32.27 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  28.08 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  28.35 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  34.55 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  27.27 
 
 
460 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  27.8 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  25.82 
 
 
479 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  27.91 
 
 
462 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  25.96 
 
 
456 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  28 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  29.33 
 
 
469 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  29.91 
 
 
455 aa  57  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  26.02 
 
 
447 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  26.81 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  30.09 
 
 
463 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  30.09 
 
 
460 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  24.19 
 
 
482 aa  53.1  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  28.95 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  27.01 
 
 
467 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  29.65 
 
 
492 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  28.02 
 
 
482 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  29.82 
 
 
462 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  31.9 
 
 
466 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  31.43 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  27.97 
 
 
512 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  31.07 
 
 
466 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  37.29 
 
 
484 aa  46.6  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  24.43 
 
 
481 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  23.91 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  24.64 
 
 
477 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  31.91 
 
 
475 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>