99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7759 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
456 aa  911    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  67.6 
 
 
466 aa  579  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  54.05 
 
 
475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  52.35 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  53.28 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  51.2 
 
 
455 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  40.83 
 
 
480 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  40.83 
 
 
480 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  40.83 
 
 
480 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  39.61 
 
 
480 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  40.73 
 
 
467 aa  303  5.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  39.52 
 
 
477 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  39.12 
 
 
478 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  39.09 
 
 
492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  39.4 
 
 
444 aa  247  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  32.6 
 
 
469 aa  200  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  25.85 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  29.22 
 
 
456 aa  169  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  28.63 
 
 
460 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  28.18 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  31.06 
 
 
447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  31.34 
 
 
453 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  30.57 
 
 
463 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  28.04 
 
 
481 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  30.75 
 
 
462 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  27.41 
 
 
462 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  28.27 
 
 
458 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  28.25 
 
 
482 aa  150  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  30.48 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  28.33 
 
 
476 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  25.93 
 
 
479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  32.95 
 
 
466 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  35.9 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  35.48 
 
 
489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  35.41 
 
 
466 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  35.41 
 
 
466 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  25.82 
 
 
468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  33.49 
 
 
507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  24.24 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  32.74 
 
 
444 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  32.21 
 
 
508 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  27.92 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  28.16 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  29.06 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  28.7 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  31.08 
 
 
386 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  26.67 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  30.25 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  28.16 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  28.63 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  31.37 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  27.59 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  29.13 
 
 
403 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  25 
 
 
409 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  25.12 
 
 
415 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  28.3 
 
 
380 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  29.27 
 
 
394 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  29.33 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  27.34 
 
 
398 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  28.35 
 
 
370 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  25.69 
 
 
427 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  31.93 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  31.36 
 
 
392 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  27.78 
 
 
398 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  23.43 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3988  VWA containing CoxE family protein  24.54 
 
 
393 aa  54.7  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  29.38 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  25.97 
 
 
398 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  41.18 
 
 
405 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  27.46 
 
 
375 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  26.44 
 
 
401 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  25.67 
 
 
414 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  26 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  27.24 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2057  hypothetical protein  24.73 
 
 
390 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5019  VWA containing CoxE family protein  29.74 
 
 
400 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  28.99 
 
 
401 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  30.36 
 
 
393 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  25.86 
 
 
415 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  39.44 
 
 
428 aa  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3607  hypothetical protein  23.91 
 
 
396 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  28.1 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  40.85 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  37.68 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  37.68 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2124  hypothetical protein  23.95 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.466092  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  30 
 
 
377 aa  47.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  28.15 
 
 
404 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  26.57 
 
 
400 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6258  hypothetical protein  22.79 
 
 
391 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  49.21 
 
 
460 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.93 
 
 
401 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  25.4 
 
 
407 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  49.21 
 
 
459 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  30.66 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  39.13 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  26.4 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1409  hypothetical protein  21.79 
 
 
392 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  28.05 
 
 
389 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>