111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0969 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  100 
 
 		 421 aa  830    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  51.96 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  53.25 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  50.12 
 
 		 427 aa  359  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  49.75 
 
 		 429 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  53.3 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  53.05 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  52.27 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  45.48 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  48.98 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  49.1 
 
 		 394 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  46.77 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  47.29 
 
 		 405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  48.57 
 
 		 395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  46.06 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  46.51 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  46.27 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  48.81 
 
 		 407 aa  322  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  48.59 
 
 		 403 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  47.41 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  47.52 
 
 		 410 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  47.52 
 
 		 410 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  44.57 
 
 		 460 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  46.63 
 
 		 459 aa  308  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  46.9 
 
 		 409 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  45.93 
 
 		 410 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  46.21 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  46.17 
 
 		 411 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  47.4 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  46.34 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  42.78 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  40.1 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  41.18 
 
 		 405 aa  263  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  42.11 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  41.49 
 
 		 401 aa  256  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  43.01 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  40.26 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  43.15 
 
 		 424 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  40.84 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  32.99 
 
 		 415 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  37.18 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  34.58 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  36.97 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  36.25 
 
 		 404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  35.37 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  34.69 
 
 		 415 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  31.62 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  35.1 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  33.07 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  32.63 
 
 		 364 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  32.3 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  33.33 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  28.68 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  34.15 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  31.61 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  33.6 
 
 		 377 aa  126  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  32.14 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  31.42 
 
 		 398 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  28.92 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  29.08 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  29.48 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  34.95 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  26.79 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  28.5 
 
 		 422 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  28.5 
 
 		 422 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  33.5 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  28.5 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  35.45 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  24.57 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  27.45 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  24 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  26.52 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  23.31 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  25.9 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  26.19 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  25.1 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  30.33 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  24.2 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  28.22 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  33.73 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  32.02 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  26.92 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  28.37 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  30.91 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  30.91 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  30.91 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  28.92 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  31.18 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  26.13 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  31.33 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  28.48 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  26.79 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  29.36 
 
 		 466 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  23.33 
 
 		 468 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  23.32 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  26.42 
 
 		 476 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  31.8 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  27.91 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  24.91 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  25.13 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>