102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12453 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  82.73 
 
 
480 aa  776    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  82.73 
 
 
480 aa  776    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  83.37 
 
 
478 aa  778    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  82.73 
 
 
480 aa  776    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  82.62 
 
 
477 aa  764    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  973    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  48.42 
 
 
467 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  49.9 
 
 
484 aa  402  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  45.73 
 
 
492 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  44.21 
 
 
475 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  42.5 
 
 
482 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  42.15 
 
 
466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  39.82 
 
 
456 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  39.14 
 
 
455 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  36.07 
 
 
444 aa  236  7e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  32.4 
 
 
469 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  30.9 
 
 
458 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  29.89 
 
 
462 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  28.81 
 
 
463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  29.94 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  27.03 
 
 
481 aa  168  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  34.91 
 
 
492 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  26.82 
 
 
456 aa  161  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  25.51 
 
 
460 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  27.85 
 
 
476 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  30.53 
 
 
447 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  33.47 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  29.95 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  25.92 
 
 
462 aa  147  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  31.21 
 
 
466 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  23.66 
 
 
462 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 
508 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  39.02 
 
 
507 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  36.97 
 
 
466 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  36.97 
 
 
466 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  34.48 
 
 
482 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  35.41 
 
 
512 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  23.63 
 
 
479 aa  123  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  33.48 
 
 
489 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  32.3 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  30.64 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  23.81 
 
 
444 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  32.21 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  30.25 
 
 
460 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  28.44 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  23.5 
 
 
445 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  29.54 
 
 
459 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  29.81 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  31.84 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  29.54 
 
 
411 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  27.96 
 
 
403 aa  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  31.84 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  28.37 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  29.38 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  31.84 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  28.22 
 
 
418 aa  60.1  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  26.79 
 
 
420 aa  60.1  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  30.91 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  26.44 
 
 
389 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  26.97 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  33.61 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  30.48 
 
 
403 aa  58.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  30.12 
 
 
429 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  26.57 
 
 
380 aa  57.4  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  32.79 
 
 
398 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  26.83 
 
 
405 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  26.24 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  27.61 
 
 
393 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  25.87 
 
 
408 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  28.66 
 
 
392 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  33.61 
 
 
395 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  31.98 
 
 
400 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  29.9 
 
 
394 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  20.7 
 
 
415 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  26.85 
 
 
401 aa  53.9  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  26.26 
 
 
409 aa  53.9  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  32.18 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  29.14 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  31.45 
 
 
398 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  25.28 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  24.26 
 
 
342 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  26.53 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  32.32 
 
 
427 aa  50.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  29.47 
 
 
375 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2057  hypothetical protein  21.58 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5019  VWA containing CoxE family protein  25 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  26.92 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  28.64 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  39.51 
 
 
421 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  30.43 
 
 
415 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  27.82 
 
 
379 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  27.62 
 
 
422 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  27.62 
 
 
422 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  27.62 
 
 
422 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  27.33 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  27.01 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  32.35 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  25.68 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  26.36 
 
 
379 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  28.78 
 
 
401 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>