111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0034 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  89.03 
 
 		 401 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  100 
 
 		 400 aa  794    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  37.06 
 
 		 371 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  40.88 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  34.96 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  37.13 
 
 		 386 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  36.41 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  30.63 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  31.62 
 
 		 428 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  30.03 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  31.07 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  29.71 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  32.84 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  29.68 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  30.53 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  31.1 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  31.09 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  31.27 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  32.55 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  32.04 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  26.61 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  31.1 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  34.24 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  34.24 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  34.08 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  32.11 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  32.6 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  34.41 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  39.6 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  32.29 
 
 		 375 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  35.87 
 
 		 411 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  27.72 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  28.11 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  38.6 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  30.57 
 
 		 389 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  33.05 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  35.35 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  30.83 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  31.98 
 
 		 364 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  30.68 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  31.54 
 
 		 379 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  27.73 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  28.79 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  30.46 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  28.61 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  32.89 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  28.8 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  32.64 
 
 		 429 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  31.58 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  27.72 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  30.1 
 
 		 427 aa  106  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  27.08 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  29.01 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  33.47 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  28.46 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  34.34 
 
 		 400 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  31.9 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  33.74 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  29.32 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  30.39 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  29.37 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  37.43 
 
 		 419 aa  96.3  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  30.61 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  29.22 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  27.18 
 
 		 479 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  30.47 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  28.17 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  31.29 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  28.82 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  31.18 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  31.18 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  28.17 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  27.78 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  31.36 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  25.31 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  30.26 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  29.49 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  27.27 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  32.34 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  32.49 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  27.89 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  30.09 
 
 		 507 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  29.9 
 
 		 462 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  28.72 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  25.1 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  31.31 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  30.33 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  24.27 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  28.96 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  28.35 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  31.68 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  28.14 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  29.49 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  29.49 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  29.88 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  29.88 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  29.88 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  29.88 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  28.64 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>