99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4953 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
379 aa  740    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  61.92 
 
 
379 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  55.68 
 
 
389 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  55.04 
 
 
395 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  54.21 
 
 
364 aa  341  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  56.52 
 
 
398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  55.49 
 
 
370 aa  333  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  57.76 
 
 
385 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  46.45 
 
 
380 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  40.74 
 
 
415 aa  242  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  37.63 
 
 
404 aa  235  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  34.55 
 
 
415 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  37.11 
 
 
393 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  34.92 
 
 
389 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  36.1 
 
 
405 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  40.82 
 
 
404 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  35.08 
 
 
408 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  35.4 
 
 
407 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  34.04 
 
 
401 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  34.5 
 
 
418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  41.19 
 
 
375 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  33.07 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  33.25 
 
 
410 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  34.47 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  33.07 
 
 
405 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  39.66 
 
 
419 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  34.77 
 
 
427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  33.25 
 
 
414 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  32.72 
 
 
405 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  40.5 
 
 
401 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  34.81 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  34.81 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  32.49 
 
 
420 aa  173  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  35.58 
 
 
411 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  35.81 
 
 
410 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  34.29 
 
 
407 aa  169  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  34.68 
 
 
410 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  33.24 
 
 
403 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  34.37 
 
 
419 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  34.73 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  34.97 
 
 
459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  35.58 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  39.28 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  33.68 
 
 
429 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  36.17 
 
 
410 aa  163  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  33.95 
 
 
428 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  33.24 
 
 
409 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  33 
 
 
403 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  32.35 
 
 
395 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  32.7 
 
 
394 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  34.26 
 
 
404 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  32.28 
 
 
386 aa  142  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  32.55 
 
 
421 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  34.69 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  37.14 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  31.15 
 
 
394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  31.54 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  31.44 
 
 
371 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  34.2 
 
 
403 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.1 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  34.48 
 
 
422 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  34.48 
 
 
422 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  32.47 
 
 
424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  34.29 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  29.25 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  29.82 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  36.63 
 
 
377 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  36.31 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  37.19 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  25 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  29.22 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  26.8 
 
 
460 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  27.7 
 
 
467 aa  63.5  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  28.87 
 
 
445 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  23.61 
 
 
444 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  29.61 
 
 
512 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  29.61 
 
 
447 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  27.91 
 
 
492 aa  57.4  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  27.01 
 
 
477 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  25.84 
 
 
462 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  25.93 
 
 
480 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  25.93 
 
 
480 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  25.93 
 
 
480 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  26.54 
 
 
478 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  27.98 
 
 
482 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  27.82 
 
 
480 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  28.31 
 
 
463 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  32.54 
 
 
466 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  26.85 
 
 
460 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  26.39 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  24.43 
 
 
481 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  25.12 
 
 
456 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  25.24 
 
 
462 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  27.27 
 
 
508 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  28.12 
 
 
475 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  25.12 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  26.19 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  23.5 
 
 
492 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  29.82 
 
 
484 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>