112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1230 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  100 
 
 		 482 aa  966    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  80.95 
 
 		 475 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  54.05 
 
 		 456 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  55.49 
 
 		 484 aa  458  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  54.49 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  44.93 
 
 		 455 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  45.61 
 
 		 478 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  45.4 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  44.98 
 
 		 480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  44.98 
 
 		 480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  44.98 
 
 		 480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  42.92 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  39.75 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  37.99 
 
 		 492 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  40.04 
 
 		 444 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  32.99 
 
 		 469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  26.2 
 
 		 492 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  28.01 
 
 		 456 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  29.78 
 
 		 460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  27.91 
 
 		 481 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  31.26 
 
 		 458 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  31.99 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  30.06 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  31.2 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  31.2 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  29.65 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  31.69 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  27.94 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  32.43 
 
 		 466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  29.69 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  25.05 
 
 		 482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  26.01 
 
 		 479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  36.02 
 
 		 466 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  36.02 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  35.22 
 
 		 507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  34.8 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  33.17 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  36.02 
 
 		 489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  34.38 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  29.77 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  33.05 
 
 		 508 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  29.96 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  32.84 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  26.9 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  36.59 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  29.06 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  33.13 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  30.6 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  30.6 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  27.4 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  30.38 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  27.57 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  28.46 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  30.25 
 
 		 405 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  27.53 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  28.71 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  25.73 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  29.31 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  27.13 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  29.27 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  29.65 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  29.67 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  28.91 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  26.41 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  26.92 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  28.43 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  29.81 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  26.94 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  28.18 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  28.93 
 
 		 364 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  31.14 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  29.13 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  29.2 
 
 		 411 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  29.17 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  28.23 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  29.65 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  29.2 
 
 		 410 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  29.2 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  26.26 
 
 		 375 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  28.05 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  30 
 
 		 407 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  27.65 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  29.82 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  29.08 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1604  hypothetical protein  23.53 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  28.05 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5019  VWA containing CoxE family protein  27.83 
 
 		 400 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  30.41 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  28.28 
 
 		 410 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  27.76 
 
 		 395 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  28.44 
 
 		 404 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  25.3 
 
 		 342 aa  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  34.4 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  29.06 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2057  hypothetical protein  22.16 
 
 		 390 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  37.18 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  29.09 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3988  VWA containing CoxE family protein  26.49 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  27.03 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  23.29 
 
 		 400 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>