110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0535 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 462 aa  946    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  91.11 
 
 		 462 aa  845    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  47.36 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  38.44 
 
 		 460 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  29.94 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  27.66 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  31.87 
 
 		 466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  28.02 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  30.47 
 
 		 507 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  29.49 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  28.06 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  29.18 
 
 		 462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  28.24 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  28.14 
 
 		 458 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  31.33 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  31.33 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  27.23 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  28.29 
 
 		 508 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  24.8 
 
 		 492 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  28.86 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  27.89 
 
 		 455 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  26.93 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  26.93 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  26.93 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  26.6 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  28.26 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  26.26 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  37.86 
 
 		 466 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  25.93 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  25.6 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  26.86 
 
 		 469 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  25.97 
 
 		 512 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  24.9 
 
 		 480 aa  123  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  26.41 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  24.46 
 
 		 492 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  31.94 
 
 		 453 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  27.43 
 
 		 468 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  28.27 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  33.67 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  23.68 
 
 		 489 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  24.76 
 
 		 479 aa  90.1  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  23.53 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  30.77 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  29.13 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  29.39 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  27.68 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  27.49 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  27.21 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  26.83 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  26.22 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  27.22 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  29.63 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  25.49 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  25.49 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  27.43 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  25.98 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  27.35 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  27.09 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  27.13 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  26.69 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  27.8 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  24.04 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  26.88 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  27.14 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  27.14 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  23.74 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  27.09 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.64 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  25.73 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  27.69 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.43 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  26.16 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  27.33 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  25.78 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  22.53 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  25.98 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  26.3 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  26.54 
 
 		 429 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  26.54 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  30 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  25.1 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  25.93 
 
 		 407 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  25.61 
 
 		 394 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  28.38 
 
 		 370 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  25.96 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  25.43 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  23.14 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  28.22 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  29.3 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  25.25 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  25.37 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  25.61 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  28.06 
 
 		 364 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  28.71 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  26.79 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1604  hypothetical protein  21.46 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3782  VWA containing CoxE family protein  22.84 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858588  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  24.41 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  25.3 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32870  hypothetical protein  22.54 
 
 		 392 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>