116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4081 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
444 aa  911    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  33.04 
 
 
479 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  33.79 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  22.47 
 
 
456 aa  143  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  24.49 
 
 
481 aa  143  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  24.78 
 
 
462 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  24.67 
 
 
460 aa  126  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  24.95 
 
 
462 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  27.45 
 
 
492 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  27.66 
 
 
458 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  24 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  27.31 
 
 
460 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  26.43 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  26.7 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  24.41 
 
 
482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  32.74 
 
 
456 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  25.17 
 
 
468 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  25.65 
 
 
467 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  29.96 
 
 
482 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  28.51 
 
 
492 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  34.76 
 
 
386 aa  104  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  25.65 
 
 
447 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  27.19 
 
 
455 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  29.29 
 
 
466 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  25.53 
 
 
410 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  30.4 
 
 
475 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  25.53 
 
 
410 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  30.6 
 
 
393 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  32.35 
 
 
401 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  28.4 
 
 
476 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  28.07 
 
 
512 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  27.47 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  27.47 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  36.16 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  29.46 
 
 
453 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  26.92 
 
 
444 aa  97.1  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  27.04 
 
 
466 aa  96.3  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  32.37 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  31.7 
 
 
466 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  31.71 
 
 
405 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  28.89 
 
 
484 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  31.22 
 
 
414 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  24.89 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  30.58 
 
 
380 aa  90.5  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  27.9 
 
 
408 aa  89.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  30.8 
 
 
405 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  25.37 
 
 
507 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  29.9 
 
 
409 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  28.91 
 
 
508 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  27.38 
 
 
371 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  31.38 
 
 
401 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  24.65 
 
 
405 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  28.05 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  28.76 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  32.35 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  24.71 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  27.83 
 
 
460 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  24.38 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  30.95 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  26.75 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  26.55 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  27.45 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  31.02 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  26.64 
 
 
418 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  25.45 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  27.27 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  23.38 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  23.38 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  23.38 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  25.95 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  26.1 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.57 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  28.5 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  23.12 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.5 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  28.08 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  33.91 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  23.12 
 
 
478 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  21.58 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  31.98 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  27.88 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  30.92 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  27.1 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  28.16 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  26.42 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  26.82 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  31.84 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  26.64 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  26.89 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  28.74 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  27.65 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  29.07 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  25.74 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  23.2 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  24.89 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  29.32 
 
 
404 aa  67  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  26.45 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  25.27 
 
 
389 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  24.12 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  31.18 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>