151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0784 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 444 aa  858    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  40.12 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  41.44 
 
 		 475 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  39.83 
 
 		 455 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  39.83 
 
 		 456 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  39.79 
 
 		 484 aa  269  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  36.88 
 
 		 478 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  36.52 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  35.85 
 
 		 480 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  35.85 
 
 		 480 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  35.85 
 
 		 480 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  39.02 
 
 		 466 aa  243  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  35.85 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  32.92 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  35.24 
 
 		 469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  33.41 
 
 		 467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  31.05 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  33.55 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  33.98 
 
 		 462 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  31.96 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  33.06 
 
 		 481 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  27.99 
 
 		 456 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  32.75 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  32.57 
 
 		 447 aa  170  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  33.4 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  29.93 
 
 		 482 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  34.36 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  34.36 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  31.45 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  45.1 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  29.3 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  27.73 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  24.62 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  32.19 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  37.38 
 
 		 508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  35.84 
 
 		 512 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  28.42 
 
 		 462 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  37.78 
 
 		 507 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  37.56 
 
 		 489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  24.72 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  28.51 
 
 		 468 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  33.62 
 
 		 476 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  25.38 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  32.84 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  33.66 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  29.06 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  33.67 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  36.16 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  31.28 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  31.02 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.33 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  31.42 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  30.49 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6258  hypothetical protein  30.26 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  32.35 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2057  hypothetical protein  27.66 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  30.29 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  30.29 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2124  hypothetical protein  25.17 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.466092  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2536  hypothetical protein  22.58 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129382  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  31.43 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  32.32 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  30.96 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  38.46 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  30.24 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2515  hypothetical protein  23.99 
 
 		 392 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.762903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  30.2 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  29.26 
 
 		 403 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  27.04 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  30.05 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  30.57 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  29.67 
 
 		 411 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1913  hypothetical protein  29.74 
 
 		 391 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0562302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  32.37 
 
 		 394 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4135  hypothetical protein  29.74 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170456  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1091  hypothetical protein  27.27 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.613907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  27.67 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  32.52 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3459  hypothetical protein  26.47 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0190687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0905  hypothetical protein  27.43 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.687363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4469  hypothetical protein  26.29 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0927  hypothetical protein  28.35 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.045473  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0862  hypothetical protein  27.85 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0358737  normal  0.649536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  27.73 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1659  hypothetical protein  27.32 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2882  hypothetical protein  27.32 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  36.22 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3559  hypothetical protein  27.32 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306765  normal  0.452046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2359  hypothetical protein  27.66 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.588957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2356  VWA containing CoxE family protein  31.25 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1718  hypothetical protein  27.17 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0616459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5019  VWA containing CoxE family protein  29.07 
 
 		 400 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1721  VWA containing CoxE-like  31.25 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0167307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2333  VWA containing CoxE family protein  31.25 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0996  hypothetical protein  28.98 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.397652  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5675  hypothetical protein  30.68 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  29.41 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1219  hypothetical protein  25.77 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.698827  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  35.43 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1787  hypothetical protein  25.79 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>