102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0103 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  100 
 
 		 456 aa  936    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  39.75 
 
 		 481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  37.53 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  37.86 
 
 		 463 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  38.79 
 
 		 460 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  37.06 
 
 		 462 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  28.39 
 
 		 460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  27.68 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  31.57 
 
 		 455 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  27.06 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  30.09 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  28.51 
 
 		 482 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  27.66 
 
 		 462 aa  163  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  27.33 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  29.19 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  27.27 
 
 		 507 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  27.82 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  26.79 
 
 		 480 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  26.79 
 
 		 480 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  26.79 
 
 		 480 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  29.17 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  28.1 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  26.47 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  26.72 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  36.05 
 
 		 466 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  31.51 
 
 		 508 aa  146  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  38.97 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  22.52 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  35.19 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  35.19 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  33.99 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  27.02 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  30.31 
 
 		 492 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  26.95 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  30.3 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  28.42 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  22.82 
 
 		 479 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  24.75 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  23.9 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  32.43 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  26.06 
 
 		 489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  25.05 
 
 		 445 aa  96.3  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  28.78 
 
 		 415 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  26.94 
 
 		 401 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  25.6 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  29.38 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  28.46 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  25.51 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  26.89 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  27.03 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  26.63 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  29.09 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  24.69 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  23.05 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  26.7 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  22.3 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  27.62 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  28.08 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  27.18 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  27.18 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  25.89 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  23.71 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  23.18 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  26.51 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  28.3 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  23.9 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  24.53 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  28.71 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  24.28 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  24.14 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  31.47 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  23.9 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  23.11 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  22.92 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  25 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  23.11 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  24.53 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  21.23 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  47.76 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  24.8 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  26.19 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  24.88 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  22.17 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  28.77 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  25.13 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  24.42 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  25.48 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  26.09 
 
 		 377 aa  57  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  26.88 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  25.68 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  24.8 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  25.09 
 
 		 394 aa  54.7  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  25.73 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  26.32 
 
 		 375 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  21.32 
 
 		 342 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  25.96 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  23.04 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  26.51 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  27.38 
 
 		 364 aa  47.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  22.71 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>