83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1566 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 		 364 aa  700    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  41.78 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  41.97 
 
 		 364 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  41.36 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  39.84 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  38.11 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  33.33 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  34.69 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  37.75 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  30.89 
 
 		 415 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  35.71 
 
 		 393 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  34.15 
 
 		 407 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  31.2 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  31.81 
 
 		 405 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  38.94 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  39 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  33.51 
 
 		 418 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  42.37 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  33.78 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  37.64 
 
 		 375 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  39.2 
 
 		 385 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  31.04 
 
 		 401 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  34.9 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  30.73 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  33.07 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  30.56 
 
 		 405 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  30.87 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  31.3 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  38.15 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  30.98 
 
 		 405 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  32.8 
 
 		 410 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  32.12 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  31.99 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  31.06 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  42.74 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  32.52 
 
 		 410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  31.71 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  28.8 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  34.56 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  32.89 
 
 		 403 aa  125  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  31.58 
 
 		 419 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  31.17 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  29.38 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  31.88 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  32.41 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  31.91 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  31.76 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  35.8 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  39.19 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  37.8 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  31.99 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  33.08 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  39.72 
 
 		 403 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  35.63 
 
 		 386 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  29.32 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  39.29 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  30.5 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  36.08 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  34.41 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  36.84 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  30.18 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  40.12 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  32.71 
 
 		 401 aa  96.7  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  32.14 
 
 		 414 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  29.19 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  38.38 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  38.38 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  38.38 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  27.94 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  35.67 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  25.87 
 
 		 460 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  28.17 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 462 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  28.64 
 
 		 508 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  30.11 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  25.51 
 
 		 467 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  26.77 
 
 		 460 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  25.68 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  22.81 
 
 		 479 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  24.43 
 
 		 453 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  26.75 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  27.01 
 
 		 476 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>