99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0614 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  100 
 
 		 462 aa  935    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  84.95 
 
 		 463 aa  765    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  73.38 
 
 		 458 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  90.48 
 
 		 460 aa  790    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  42.26 
 
 		 481 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  37.5 
 
 		 456 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  29.41 
 
 		 460 aa  212  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  30.98 
 
 		 476 aa  193  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  31.65 
 
 		 492 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  30.99 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  30.99 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  30.99 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  30.4 
 
 		 478 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  31.5 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  31.22 
 
 		 455 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  30.17 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  29.53 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  29.89 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  31.96 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  31.5 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  28.76 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  30.06 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  28.65 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  33.4 
 
 		 484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  31.62 
 
 		 482 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  30.06 
 
 		 475 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  33.21 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  35.79 
 
 		 507 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  26.88 
 
 		 482 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  30 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  38.76 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  33.04 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  34.6 
 
 		 467 aa  140  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  30.4 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  36.67 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  37.23 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  37.66 
 
 		 466 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  25.92 
 
 		 479 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  33.77 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  23.72 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  29.26 
 
 		 489 aa  114  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  25.67 
 
 		 468 aa  94  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  26.79 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  29.1 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  32.2 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  35.19 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  31.13 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  30.49 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  27.4 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  26.96 
 
 		 403 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  29.81 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  28.06 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  29.94 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  29.6 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  29.6 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  30 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  32.02 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.26 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  29.55 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  31.33 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  30.47 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  24.06 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  31.03 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  29.41 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  30.72 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  30.06 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  27.76 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  32.56 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  29.51 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  28.85 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  28.57 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  29.08 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  28.16 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  29.88 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  25 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  27.14 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  26.85 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  28.43 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  28.02 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  28.06 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  25.82 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  30.49 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  29.86 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  29.86 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  25.96 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  24.38 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  25.65 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  27.17 
 
 		 342 aa  54.3  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  29.19 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  30.49 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  28.4 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  29.11 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  24.89 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  28.57 
 
 		 375 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  27.91 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  26.75 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  28.17 
 
 		 398 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  29.82 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  22.45 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>