118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2769 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  100 
 
 
386 aa  769    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  38.32 
 
 
371 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  43.51 
 
 
377 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  37.66 
 
 
401 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  36.27 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  37.14 
 
 
410 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  38.99 
 
 
407 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  35.26 
 
 
401 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  37.14 
 
 
410 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  37.7 
 
 
393 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  34.19 
 
 
405 aa  192  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  29.89 
 
 
415 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  40.32 
 
 
393 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  37.2 
 
 
400 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  38.67 
 
 
389 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  39.42 
 
 
380 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  34.58 
 
 
418 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  34.63 
 
 
404 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  37.24 
 
 
410 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  36.34 
 
 
409 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  37.03 
 
 
459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  33.69 
 
 
414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  37.5 
 
 
460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  34.34 
 
 
398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  34.16 
 
 
398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  33.93 
 
 
405 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  33.84 
 
 
398 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  32.61 
 
 
405 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  31.41 
 
 
401 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  33.16 
 
 
408 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  32.64 
 
 
427 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  35.64 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  34.38 
 
 
403 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  31.82 
 
 
419 aa  167  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  38.3 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  29.58 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  35.25 
 
 
379 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  32.97 
 
 
400 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  32.53 
 
 
429 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  35.19 
 
 
370 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  32.7 
 
 
395 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  35.64 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  34.3 
 
 
394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  37.41 
 
 
407 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  33.06 
 
 
410 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  33.16 
 
 
401 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  31.55 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  34.95 
 
 
414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  33.79 
 
 
404 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  36.75 
 
 
364 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  31.58 
 
 
394 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  31.35 
 
 
395 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  35.22 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  34.33 
 
 
385 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  35.48 
 
 
424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  33.24 
 
 
379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  33.59 
 
 
389 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  30.61 
 
 
403 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  38.3 
 
 
401 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  38.19 
 
 
404 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  37.07 
 
 
375 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  35.85 
 
 
419 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  31.68 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  35.62 
 
 
444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  36.87 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  32.45 
 
 
479 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  34.31 
 
 
492 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  40.34 
 
 
445 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  35.74 
 
 
481 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  35.12 
 
 
458 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  35.68 
 
 
403 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  35.38 
 
 
453 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  34.15 
 
 
460 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  33.82 
 
 
482 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  33.66 
 
 
463 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  33.17 
 
 
462 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  33.84 
 
 
372 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  27.31 
 
 
456 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  38 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  38 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  35.12 
 
 
507 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  36.87 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  30.42 
 
 
462 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  31.1 
 
 
467 aa  90.1  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  33.15 
 
 
342 aa  89.7  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  32.58 
 
 
460 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  35.8 
 
 
466 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  31.98 
 
 
456 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  31.67 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  32.84 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  30.83 
 
 
512 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  28.45 
 
 
462 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  32.2 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  31.74 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  32.93 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  32.93 
 
 
492 aa  79.3  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  32.43 
 
 
469 aa  79.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  34.5 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  33.63 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  32.75 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>