99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2692 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  72.73 
 
 		 462 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  71.15 
 
 		 463 aa  658    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  932    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  74.68 
 
 		 460 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  42.56 
 
 		 481 aa  358  8e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  37.53 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  30.87 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  32.77 
 
 		 480 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  32.77 
 
 		 480 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  32.77 
 
 		 480 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0292  VWA containing CoxE family protein  32.08 
 
 		 455 aa  186  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.298693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3932  VWA containing CoxE family protein  32.35 
 
 		 478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.789566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  32.76 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  30.79 
 
 		 476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  29.55 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  31.14 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  30.96 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5254  VWA containing CoxE family protein  30.88 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  31.79 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5477  VWA containing CoxE family protein  35.79 
 
 		 507 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85844  normal  0.344789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  28.48 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3130  VWA containing CoxE family protein  28.63 
 
 		 482 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  28.99 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  31.65 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1583  VWA containing CoxE-like  29.87 
 
 		 447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.503012 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  32.68 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  27.33 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7759  VWA containing CoxE family protein  28.48 
 
 		 456 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  29.82 
 
 		 492 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  32.88 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  39.73 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  38.27 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1608  VWA containing CoxE family protein  37.5 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414419  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1513  VWA containing CoxE family protein  38.53 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.026698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2356  VWA containing CoxE-like  38.1 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3195  VWA containing CoxE family protein  35.44 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2180  VWA containing CoxE family protein  30.74 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000634793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  25.88 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  23.33 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  24.78 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0854  VWA containing CoxE family protein  34.1 
 
 		 489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  22.67 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  23.75 
 
 		 445 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  29.81 
 
 		 371 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  34.15 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  31.29 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  30.49 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  23.96 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  28.23 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  26.76 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  35.37 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  30.19 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  31.29 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  27.31 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  29.52 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  29.25 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  29.72 
 
 		 414 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.81 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  31.16 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  30.77 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  30.77 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  28.65 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.26 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  25.84 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  29.41 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  27.54 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  30.12 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  28.96 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  25.62 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  31.48 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  29.85 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  32.11 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  27.57 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  27.18 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  28.44 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  27.4 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  29.1 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  30.26 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  27.19 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  26.95 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  23.61 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  29.93 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  30.86 
 
 		 403 aa  54.7  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  26.21 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  29.93 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  28.51 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  27.72 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  28.37 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  30.61 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  23.77 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  29.17 
 
 		 398 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  28.11 
 
 		 370 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  27.14 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  29.45 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  27.49 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  26.39 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  27.14 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  29.17 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  25.13 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>