112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0361 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0361  VWA containing CoxE-like protein  100 
 
 		 428 aa  848    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0421  VWA containing CoxE-like  84.05 
 
 		 409 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0366  VWA containing CoxE family protein  67.25 
 
 		 460 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1350  VWA containing CoxE family protein  67.96 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671625  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1414  VWA containing CoxE family protein  67.7 
 
 		 410 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4355  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  66.92 
 
 		 459 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1465  hypothetical protein  67.53 
 
 		 410 aa  487  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0091  VWA containing CoxE family protein  67.27 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5315  hypothetical protein  44.1 
 
 		 401 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  43.53 
 
 		 414 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  44.62 
 
 		 405 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3675  VWA containing CoxE-like  44.3 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2202  VWA containing CoxE-like  42.38 
 
 		 408 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1769  VWA containing CoxE-like  43.47 
 
 		 427 aa  283  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1291  VWA containing CoxE-like  42.86 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0969  VWA containing CoxE-like  46.48 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  43.58 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0472  VWA containing CoxE family protein  44.33 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2604  VWA containing CoxE-like  43.7 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2958  VWA containing CoxE family protein  44.27 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.958684  hitchhiker  0.00204409 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1932  hypothetical protein  43.62 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4713  VWA containing CoxE family protein  44.09 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0583  VWA containing CoxE family protein  43.37 
 
 		 398 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0976244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1484  VWA containing CoxE family protein  43.6 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.0167248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1760  VWA containing CoxE-like  39.36 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00982397  normal  0.464632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2355  hypothetical protein  38.65 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.624268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0328  VWA containing CoxE family protein  42.56 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5446  VWA containing CoxE family protein  40.51 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.337348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1753  VWA containing CoxE family protein  40.89 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.094345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2376  VWA containing CoxE family protein  40.93 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.242837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2165  VWA containing CoxE family protein  39.38 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2700  VWA containing CoxE family protein  37.69 
 
 		 404 aa  231  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.877474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1597  VWA containing CoxE family protein  39.43 
 
 		 404 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.795789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1453  VWA containing CoxE family protein  38.68 
 
 		 407 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2833  VWA containing CoxE family protein  39.74 
 
 		 405 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0115  VWA containing CoxE-like protein  36.99 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1141  VWA containing CoxE family protein  33.42 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0574  VWA containing CoxE-like  36.05 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1523  VWA containing CoxE family protein  34.99 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4536  VWA containing CoxE family protein  36.32 
 
 		 414 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2769  VWA containing CoxE family protein  36.15 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2252  VWA containing CoxE family protein  36.13 
 
 		 424 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1751  carbon monoxide dehydrogenase, coxE accessory protein  36.73 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2093  VWA containing CoxE-like  32.37 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2979  VWA containing CoxE family protein  32.91 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000279133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13090  protein containing von Willebrand factor type A (vWA) domain protein  36.14 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1384  VWA containing CoxE family protein  35.29 
 
 		 398 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0863864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0238  VWA containing CoxE family protein  38.15 
 
 		 375 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6197  VWA containing CoxE family protein  33.99 
 
 		 385 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.787747  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3031  VWA containing CoxE family protein  41.11 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  0.0122091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4953  VWA containing CoxE family protein  34.66 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2035  VWA containing CoxE family protein  32.99 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0522892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3974  VWA containing CoxE family protein  33.81 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0702062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2844  VWA containing CoxE family protein  33.42 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800418  normal  0.0397253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4314  VWA containing CoxE family protein  36.01 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2149  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  33.42 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406985  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0034  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxE subunit  32.65 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5290  VWA containing CoxE family protein  38.11 
 
 		 419 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1214  VWA containing CoxE family protein  31.58 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4107  VWA containing CoxE family protein  32.66 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.739677  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1566  VWA containing CoxE family protein  33.33 
 
 		 377 aa  136  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1566  VWA containing CoxE family protein  34.4 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4806  hypothetical protein  30.41 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0211  VWA containing CoxE-like protein  32.35 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1374  VWA containing CoxE family protein  27.53 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.400555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4081  VWA containing CoxE family protein  32.37 
 
 		 444 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000060057  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10373  hypothetical protein  31.4 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0495  VWA containing CoxE-like protein  28.13 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0506  VWA containing CoxE family protein  28.13 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0807  VWA containing CoxE family protein  25.1 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0395672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0484  VWA containing CoxE family protein  27.88 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.258737  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2181  VWA containing CoxE family protein  29.59 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  28.28 
 
 		 462 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0047  VWA containing CoxE family protein  29.15 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0535  VWA containing CoxE family protein  27.21 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0103  VWA containing CoxE-like  28.71 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0826  VWA containing CoxE-like  29.38 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0518473  normal  0.175459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0813  VWA containing CoxE family protein  28.14 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0718  VWA containing CoxE-like  29.79 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1956  VWA containing CoxE family protein  28.91 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0614  VWA containing CoxE-like  29.08 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.846272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1513  VWA containing CoxE family protein  32.41 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0878716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2760  VWA containing CoxE family protein  24.63 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0758  VWA containing CoxE family protein  29.85 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0779  VWA containing CoxE family protein  29.02 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2809  VWA containing CoxE family protein  28.31 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1264  VWA containing CoxE family protein  24.36 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.225553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1645  VWA containing CoxE family protein  29.69 
 
 		 469 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.127622  normal  0.403953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2692  hypothetical protein  26.95 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1933  VWA containing CoxE family protein  27.01 
 
 		 508 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12453  hypothetical protein  30.91 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.567025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1605  VWA containing CoxE family protein  37.5 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0333325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0559  VWA containing CoxE family protein  31.12 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2646  VWA containing CoxE family protein  30.91 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3536  VWA containing CoxE-like protein  29.7 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3609  VWA containing CoxE family protein  29.7 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.521767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3541  VWA containing CoxE family protein  29.7 
 
 		 480 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1230  VWA containing CoxE-like  27.65 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717442  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3566  VWA containing CoxE family protein  20.18 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.99773  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0784  VWA containing CoxE family protein  30.24 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>